Традиционная система верований селькупов основана на представлениях о духах-хозяевах мест. Они верили в духа леса мачиль лоз, духа-хозяина воды утыкль-лоз, и др. Духам приносили различные жертвы, чтобы заручиться поддержкой во время промысла.
Верховным богом, олицетворяющим небо, селькупы считали Нума. Обитателем подземного мира, властителем зла выступал в селькупской мифологии подземный дух Кызы. У этого духа были многочисленные помощники - лозы, которые проникали в человеческое тело и вызывали болезни. Для борьбы с болезными селькупы обращались к шаману, который вместе со своими духами-помощниками вступал в борьбу со злыми духами и пытался изгнать их из духа человека. Если это удавалось человеку, то человек выздоравливал.
Земля обитания представлялась селькупам изначально ровной и плоской, покрытой травой-мхом и лесом - волосами матери-земли. Все земные возвышенности и углубления селькупы трактовали как свидетельства происходивших в прошлом событий: битв богатырей, брошенных с неба камней-молний. Млечный путь на небе представлялся каменной рекой, которая переходит на землю и течёт рекой Обью, замыкая собой мир в единое целое.
У селькупов существовали специальные жертвенные места - святилища в виде небольших бревенчатых амбарчиков на одной ножке-стойке, с установленными внутри деревянными духами - лозами. в эти амбарчики селькупы приносили различные жертвы в виде монет, посуды, предметов бытового значения и т.д.